EU komission mukaan, vuodesta 2006 saakka tappiota tehnyt, Estonian Air on saanut tukia jo kolmesti. EU:n tukisääntöjen mukaan rahoitusta voidaan antaa vain kerran kymmenen vuoden aikana. Vuonna 2009 tapahtumeen maahuolintayhtiön myynti valtion omistamalle lentoasemalla saatetaan katsia laittomaksi tueksi. Tutkimusten alkuvaiheessa komissio epäilee etteivät nämä neljä rahoituskertaa ole sellaisia joita yksityinen sijoittaja olisi markkinaoloissa tehnyt. Näin ollen tukisääntöjä olisi rikottu. Komissio aikoo varmentaa tilanteen tutkimuksillaan. EU komissio tutkii voidaanko tukien maksamisen katsoa tapahtuneen EU:n sääntöjen, mukaisesti lentoliikenteessä ja vaikeuksissa oleville yrityksille. Komissio on aloittanut tutkimukset myös Air Balticin ja Adria Airwaysin rahoituksista. Komisso on antanut päätökset jo aiemmin vastaavista tapauksista Air Maltan, CSA:n ja LOT:n tapauksissa.
|
|||